1. iCNV::filenm
    Name of the file
    json| rda| rds
    character
  2. iCNV::icnv_res0
    Example iCNV calling results.
    json| rda| rds
    list
  3. iCNV::ngs_baf
    BAF list from NGS
    json| rda| rds
    list
  4. iCNV::ngs_baf.chr
    BAF chromosome from NGS
    json| rda| rds
    list
  5. iCNV::ngs_baf.id
    BAF variants id from NGS
    json| rda| rds
    list
  6. iCNV::ngs_baf.nm
    BAF variants sample name from NGS
    csv| json| rda| rds
    list
  7. iCNV::ngs_baf.pos
    BAF position list from NGS
    json| rda| rds
    list
  8. iCNV::ngs_plr
    Normalized Poisson likelihood ratio list from NGS
    csv| json| rda| rds
    list
  9. iCNV::ngs_plr.pos
    Exon location list from NGS
    csv| json| rda| rds
    list
  10. iCNV::normObj
    Demo data pre-stored for normObj.
    csv| json| rda| rds
    list
  11. iCNV::qcObj
    Demo data pre-stored for qcObj.
    rda| rds
    list
  12. iCNV::sampname
    CODEX sample name
    csv| json| rda| rds
    matrix|46 x 1
  13. iCNV::sampname_qc
    QCed sample name
    json| rda| rds
    character
  14. iCNV::snp_baf
    BAF list from Array
    csv| json| rda| rds
    list
  15. iCNV::snp_baf.pos
    BAF position list from Array
    csv| json| rda| rds
    list
  16. iCNV::snp_lrr
    Normalized log R ratio list from Array
    csv| json| rda| rds
    list
  17. iCNV::snp_lrr.pos
    SNP position list from Array
    csv| json| rda| rds
    list